目的 探讨荔枝核干预结肠腺癌(COAD)进展和转移的黄酮类成分和作用靶点.方法 通过DRAR-CPI和SWISS数据库检索荔枝核中19个黄酮类化合物的潜在作用靶点.从TCGA数据库下载COAD基因表达数据和临床特征数据,采用加权基因共表达网络分析(WGCNA)法建立COAD的基因共表达网络和识别共表达模块,以共表达模块和潜在作用靶E点中共同靶点作为化合物干预COAD的作用靶点.通过String数据库进行蛋白互作网络分析、KEGG和GO分析.通过cytoHubba插件提取Hub基因作为COAD潜在生物标志物,通过Cytoscape建立成分、靶点、通路的互作网络.HPA数据库验证潜在生物标志物的表达,通过分子对接技术虚拟筛选与潜在生物标志物作用的化合物.结果 经WGCNA分析得到18个共表达模块,其中7个模块与生存时间、肿瘤分期等临床特征相关,turquoise模块与COAD进展转移相关.荔枝核中19个黄酮类化合物作用于380个潜在作用靶点,选择与turquoise模块重复的34个靶点作为作用靶点,GO分析结果显示作用靶点富在304个GO条目,其中生物过程229条、细胞组成31条、分子功能44条;KEGG分析结果显示作用靶点富集在癌症通路、细胞周期、孕酮介导的卵母癌症途径、细胞衰老、p53信号通路等40条通路.CytoHubba筛选得到CDC25A、CDC25C、CCNB2、AURKB基因作为COAD进展转
作者：严炯艺；冯茵怡；卢卓；奉建芳；罗伟生；黎芳；梁健钦
来源：中草药 2020 年 51卷 22期
