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目的 探究中医药治疗肺结节(pulmonarynodule,PN)的用药规律,预测核心药物组合的潜在作用机制,以期为后续实验研究和临床应用提供依据和参考.方法 检索中英文数据库中关于中医药治疗肺结节的文献,并进行归纳总结.构建肺结节处方数据库,运用R语言对处方进行频次统计和关联规则、聚类分析.利用网络药理学方法预测核心药物的潜在作用靶点和通路,从TCMSP数据库和OMIM等数据库中分别获取药物与肺结节相关的靶点,取交集靶点后上传至STRING数据库构建蛋白质-蛋白质互作网络,导入Cytoscape 3.7.2软件中,运用Network Analyzer工具计算网络拓扑参数并得到关键靶点.最后通过分子对接技术对关键成分与靶点进行反向验证.结果 数据库共筛选得到53首处方,涉及213味中药,统计发现这些中药多味甘、苦,性寒,归肺经.关联规则分析提示甘草与茯苓、半夏是具有强关联性的3组合药对.核心药物组合"甘草-茯苓-半夏"与肺结节的交集靶点85个,经拓扑分析得到其治疗肺结节的17个关键靶点,包括转录激活因子3(signal transducer and activator of transcription 3,STAT3)、丝氨酸/苏氨酸激酶 1(serine/threonine kinase 1,AKT1)等.基于DIVID平台进行京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析

作者:董敬;彭小芸;付西;任益锋;张龙飞;李林炯;祝捷;由凤鸣

来源:中草药 2022 年 53卷 20期

知识库介绍

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作者:
董敬;彭小芸;付西;任益锋;张龙飞;李林炯;祝捷;由凤鸣
来源:
中草药 2022 年 53卷 20期
标签:
中医药 肺结节 数据挖掘 网络药理学 分子对接 用药规律 作用机制 甘草-茯苓-半夏
目的 探究中医药治疗肺结节(pulmonarynodule,PN)的用药规律,预测核心药物组合的潜在作用机制,以期为后续实验研究和临床应用提供依据和参考.方法 检索中英文数据库中关于中医药治疗肺结节的文献,并进行归纳总结.构建肺结节处方数据库,运用R语言对处方进行频次统计和关联规则、聚类分析.利用网络药理学方法预测核心药物的潜在作用靶点和通路,从TCMSP数据库和OMIM等数据库中分别获取药物与肺结节相关的靶点,取交集靶点后上传至STRING数据库构建蛋白质-蛋白质互作网络,导入Cytoscape 3.7.2软件中,运用Network Analyzer工具计算网络拓扑参数并得到关键靶点.最后通过分子对接技术对关键成分与靶点进行反向验证.结果 数据库共筛选得到53首处方,涉及213味中药,统计发现这些中药多味甘、苦,性寒,归肺经.关联规则分析提示甘草与茯苓、半夏是具有强关联性的3组合药对.核心药物组合"甘草-茯苓-半夏"与肺结节的交集靶点85个,经拓扑分析得到其治疗肺结节的17个关键靶点,包括转录激活因子3(signal transducer and activator of transcription 3,STAT3)、丝氨酸/苏氨酸激酶 1(serine/threonine kinase 1,AKT1)等.基于DIVID平台进行京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析