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目的 采用超高效液相-四级杆-静电场轨道阱高分辨质谱(UPLC-Q-Exactive Orbitrap-MS)鉴定赶黄草全草及其茎、叶主要成分,结合网络药理学和分子对接探究赶黄草保肝作用机制.方法 利用质谱采集数据结合对照品、相关文献、数据库检索,鉴定和表征赶黄草及其茎、叶化学成分;运用TCMSP数据库结合文献报道筛选活性成分,通过TCMSP、SwissTargetPrediction数据库查找活性成分靶点;通过基因数据库筛选疾病靶点.药物靶点与疾病靶点取交,输入String11.5数据库和Cytoscape 3.7.2软件构建PPI网络筛选出核心靶点.利用DAVID 6.8进行富集分析,Cytoscape 3.7.2软件构建"活性成分-靶基因-通路"网络,利用AutoDockTools 1.5.6软件对活性成分与作用靶点进行分子对接验证.结果 在赶黄草及其茎、叶提取物中共鉴定出64种化学成分;筛选活性成分28个,成分靶点与疾病靶点交集126个,关键活性成分15个,核心靶点24个;基因本体(gene ontology,GO)功能富集163个条目,京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路分析131条通路;分子对接结果显示,成分与靶点蛋白结合活性良好.结论 对赶黄草化学成分进行了较全面地研究,初步阐明了其药效物质基础,预测赶黄草可通过多组分、多靶点、多途径和多通路发挥保肝作

作者:田海涛;蔡春颖;赵东升;张龙霏;邓志鹏

来源:中草药 2024 年 55卷 5期

知识库介绍

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作者:
田海涛;蔡春颖;赵东升;张龙霏;邓志鹏
来源:
中草药 2024 年 55卷 5期
标签:
赶黄草 UPLC-Q-Exactive Orbitrap-MS 网络药理学 分子对接 保肝活性 Penthorum chinense Pursh UPLC-Q-Exactive Orbitrap-MS network pharmacology molecular docking hepatoprotective activity
目的 采用超高效液相-四级杆-静电场轨道阱高分辨质谱(UPLC-Q-Exactive Orbitrap-MS)鉴定赶黄草全草及其茎、叶主要成分,结合网络药理学和分子对接探究赶黄草保肝作用机制.方法 利用质谱采集数据结合对照品、相关文献、数据库检索,鉴定和表征赶黄草及其茎、叶化学成分;运用TCMSP数据库结合文献报道筛选活性成分,通过TCMSP、SwissTargetPrediction数据库查找活性成分靶点;通过基因数据库筛选疾病靶点.药物靶点与疾病靶点取交,输入String11.5数据库和Cytoscape 3.7.2软件构建PPI网络筛选出核心靶点.利用DAVID 6.8进行富集分析,Cytoscape 3.7.2软件构建"活性成分-靶基因-通路"网络,利用AutoDockTools 1.5.6软件对活性成分与作用靶点进行分子对接验证.结果 在赶黄草及其茎、叶提取物中共鉴定出64种化学成分;筛选活性成分28个,成分靶点与疾病靶点交集126个,关键活性成分15个,核心靶点24个;基因本体(gene ontology,GO)功能富集163个条目,京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路分析131条通路;分子对接结果显示,成分与靶点蛋白结合活性良好.结论 对赶黄草化学成分进行了较全面地研究,初步阐明了其药效物质基础,预测赶黄草可通过多组分、多靶点、多途径和多通路发挥保肝作