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目的 通过多个数据库资料结合临床样本分析喉鳞状细胞癌(鳞癌)患者中肿瘤坏死因子受体超家族成员(TNFRSF)4表达水平的变化,研究TNFRSF4在喉鳞癌发生发展中的作用.方法 根据高通量基因表达(GEO)数据库和癌症基因组图谱(TCGA)数据库转录组表达谱数据筛选出差异表达的基因,结合基因表达谱数据动态分析(GEPIA)数据库对差异基因TNFRSF4进行表达水平预测和生存分析;同时通过3例患者的喉鳞癌组织与癌旁组织标本进行qRT-PCR和Western blot验证,基于TCGA的临床数据绘制K-M生存曲线图并进行Cox回归分析.采用基因集富集分析探究与TNFRSF4在喉鳞癌中作用有关的信号通路.结果 数据库和临床样本中,喉鳞癌组中 TNFRSF4的表达高于正常组(P<0.05),且TNFRSF4高表达组的生存率高于TNFRSF4低表达组(P<0.01).多因素的 Cox 回归分析显示,TNFRSF4 表达水平(HR:0.430,95%CI:0.229~0.806,P=0.009)、性别(HR:0.424,95%CI:0.204~0.882,P=0.022)、淋巴结分期(HR:2.010,95%CI:1.055~3.831,P=0.034)和远处转移(HR:3.706,95%CI:1.152~11.922,P=0.028)四个因素共同对患者的总生存时间产生影响.基因集富集分析的结果显示,与TNFRSF4表达最显著相关的信号通路有细胞黏附分子、JAK-STAT信号通路、T细胞受体信号通路、B细胞受体信号

作者:饶兴旺;朱凯铨;陈帅男;施丽彩;李贺;林刃舆

来源:中国临床研究 2024 年 37卷 1期

知识库介绍

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作者:
饶兴旺;朱凯铨;陈帅男;施丽彩;李贺;林刃舆
来源:
中国临床研究 2024 年 37卷 1期
标签:
喉鳞状细胞癌 肿瘤坏死因子受体超家族成员-4 癌症基因组图谱数据库 高通量基因表达数据库 基因表达谱数据动态分析数据库 预后 Laryngeal squamous cell carcinoma Tumor necrosis factor receptor superfamily 4 The Cancer Genome Atlas database Gene Expession Omnibus database Gene Expression Profiling Interactive Analysis database Prognosis
目的 通过多个数据库资料结合临床样本分析喉鳞状细胞癌(鳞癌)患者中肿瘤坏死因子受体超家族成员(TNFRSF)4表达水平的变化,研究TNFRSF4在喉鳞癌发生发展中的作用.方法 根据高通量基因表达(GEO)数据库和癌症基因组图谱(TCGA)数据库转录组表达谱数据筛选出差异表达的基因,结合基因表达谱数据动态分析(GEPIA)数据库对差异基因TNFRSF4进行表达水平预测和生存分析;同时通过3例患者的喉鳞癌组织与癌旁组织标本进行qRT-PCR和Western blot验证,基于TCGA的临床数据绘制K-M生存曲线图并进行Cox回归分析.采用基因集富集分析探究与TNFRSF4在喉鳞癌中作用有关的信号通路.结果 数据库和临床样本中,喉鳞癌组中 TNFRSF4的表达高于正常组(P<0.05),且TNFRSF4高表达组的生存率高于TNFRSF4低表达组(P<0.01).多因素的 Cox 回归分析显示,TNFRSF4 表达水平(HR:0.430,95%CI:0.229~0.806,P=0.009)、性别(HR:0.424,95%CI:0.204~0.882,P=0.022)、淋巴结分期(HR:2.010,95%CI:1.055~3.831,P=0.034)和远处转移(HR:3.706,95%CI:1.152~11.922,P=0.028)四个因素共同对患者的总生存时间产生影响.基因集富集分析的结果显示,与TNFRSF4表达最显著相关的信号通路有细胞黏附分子、JAK-STAT信号通路、T细胞受体信号通路、B细胞受体信号