目的 基于生物信息学研究手段探讨骨质疏松与脂代谢疾病的潜在关系.方法 分别以"骨质疏松""非酒精性脂肪肝""动脉粥样硬化""肥胖"和"糖尿病"为关键词在 GeneCards 数据库、在线孟德尔遗传(online mendelian inheritance in man,OMIM)数据库、Drugbank 数据库、药物靶点(therapeutic target database,TTD)数据库进行检索以收集疾病相关的靶点,取各疾病的交集靶点分别进行蛋白-蛋白互作网络构建、关键基因筛选、基因本体论(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)生物富集分析,同时构建基因调控网络以了解靶基因、药物、microRNAs、转录因子潜在的相互作用.结果 通过数据库分析共得到骨质疏松靶点 841 个,非酒精性脂肪肝靶点 1142 个,动脉粥样硬化靶点 696 个,肥胖靶点 717 个,糖尿病靶点 691 个,各数据集映射得到交集靶点 69 个,为骨质疏松和脂代谢疾病相关的关键靶点.经基因/蛋白相互作用检索搜查工具(search tool for the retrieval of interacting genes/proteins,STRING)数据库分析共得到 1372 条 GO 富集结果(P<0.05)和 136 条 KEGG 富集结果(P<0.05).在基因调控网络中筛选得到 10 种关键药物、83 个转录因子、82 个 microRNAs.结论 RAC-α
作者:张方晴;吴嘉朔;阮豪南;薛昊天;王镜勋;石钺
来源:中国骨与关节杂志 2024 年 13卷 2期