背景与目的:研究发现跨膜蛋白(TMEM)家族基因与肿瘤关系密切,TMEM201是TMEM家族的一员,其在肝细胞癌(HCC)中的表达与作用目前尚不清楚.因此,本研究通过生物信息学方法分析TMEM201在HCC中的表达与作用,并预测其在HCC中可能作用的通路,进而探讨机制.
方法:在TIMER中分析TMEM201在泛癌中的表达.下载TCGA与GEO数据库中HCC患者数据,并收集106例HCC患者的手术标本与临床信息,分析TMEM201在肝癌组织与癌旁组织中的表达情况,并绘制生存曲线,分析TMEM201表达与HCC患者的预后关系.用单因素与多因素Cox分析判断HCC相关危险因素.根据TCGA与临床数据,分析TMEM201的表达与HCC患者临床病理特征的关系.应用String和GeneMANIA数据库绘制与TMEM201及其相关基因的网络图谱.通过TCGA数据库分析TMEM201与免疫细胞的关系.通过LinkedOmics数据库分析与TMEM201相关的共表达基因,并对共表达基因进行GO功能分析与KEGG通路预测.
结果:泛癌分析结果显示,TMEM201在绝大部分肿瘤中呈高表达.多数据库及临床HCC标本免疫组化分析显示,TMEM201在HCC组织中的表达明显高于癌旁组织(均P＜0.05),且TMEM201高表达患者生存时间明显短于低表达患者.单因素与多因素Cox风险回归提示TMEM201的表达是HCC患者总体生存率的独立危险因素.蛋白质互作网络
作者：孙丹；费浩然；仲成成；杨海深；司鑫鑫；胡伟；王仲
来源：中国普通外科杂志 2024 年 33卷 1期
