目的 本项研究拟通过采用寡核苷酸芯片技术,初步筛选与肺癌分子分型相关基因,并对肺癌的基因分型诊断及肺鳞癌、肺腺癌内亚型的存在进行有益的探讨,为分子分型研究、实现个体化治疗提供一定参考依据.方法 ①共筛选了与肺癌分型、分期相关的基因332个,用NCBI提供的BLAST系统分析确定其特异性序列,利用生物学软件设计成长度为60bp寡核苷酸探针,随后点制成芯片；②分别提取95D细胞、7例肺腺癌组织、8例肺鳞癌组织的总RNA,以总RNA逆转录为cDNA,制作成有荧光标记的探针；③上述制备的杂交荧光探针与芯片进行杂交,获得杂交结果,用ScanarrayLite激光共聚焦扫描仪扫描芯片.所得图像由Genepix 5.1分析软件,分析Cy3和Cy5两种荧光信号的强度和比值,采用聚类方法分别对肺鳞癌和肺腺癌的基因表达谱进行相关性分析.结果 ①芯片杂交技术的可靠性:芯片上的332个oligo,分布在4个区域,每块区域设有阴性对照5个基因；②芯片可重复性:在基因连续横向点3个点的情况下,CV(变异系数)为10％,不同批次95D细胞与芯片杂交之间的重复性为98.2％；③7例肺腺癌组织的共有差异基因29个,与鳞癌组相区别的有7个如DCTN2、Stst2、BRCA2、TGFD等；8例肺鳞癌组织的共有差异基因46个,与腺癌组相区别的有24个,如KRT6A、HMGB2、lumican等；④7例腺
作者：常艳；陈良安；梁志欣；李增鸣
来源：中国医刊 2012 年 47卷 11期
