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目的:采用网络药理学方法研究冬虫夏草治疗糖尿病肾病(DN)的作用机制.方法:在TCMSP和SymMap数据库中检索并筛选冬虫夏草活性成分,利用TargetNet数据库和PharmMapper平台预测活性成分的靶点.借助GeneCards和CTD数据库预测DN相关靶点,并和活性成分对应靶点取交集得到冬虫夏草治疗DN的潜在作用靶点,通过富集分析探索其作用机制.在String数据库中分析潜在作用靶点的蛋白相互作用(PPI),并借助Cytoscape构建可视化网络,进行网络拓扑分析筛选核心靶点.最后,对核心靶点与其对应成分进行分子对接验证.结果:筛选得到冬虫夏草活性成分17个,对应237个靶点,将其与232个DN相关靶点取交集得到32个潜在作用靶点.其中核心靶点为丝裂原激活蛋白激酶1(MAPK1)、丝裂原激活蛋白激酶8(MAPK8)和胱天蛋白酶3(CASP3),分子对接结果显示其与对应成分之间的结合活性较好.基因本体论(GO)富集得到39条生物过程(P<0.01),主要涉及凋亡过程的负调控、细胞对胰岛素刺激的反应等.京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集得到49条通路(P<0.01),主要包括催乳素信号通路、叉头框转录因子O亚型(FoxO)信号通路、缺氧诱导因子1(HIF-1)信号通路、磷脂酰肌醇3-激酶-蛋白激酶B(PI3K-Akt)信号通路、胰岛素抵抗、血管内皮生长因子(VEGF)信号通路等.结论:冬

作者:林嫚婷;谢地;胡汉昆

来源:中国药师 2021 年 24卷 6期

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作者:
林嫚婷;谢地;胡汉昆
来源:
中国药师 2021 年 24卷 6期
标签:
冬虫夏草 糖尿病肾病 网络药理学 分子对接 作用机制
目的:采用网络药理学方法研究冬虫夏草治疗糖尿病肾病(DN)的作用机制.方法:在TCMSP和SymMap数据库中检索并筛选冬虫夏草活性成分,利用TargetNet数据库和PharmMapper平台预测活性成分的靶点.借助GeneCards和CTD数据库预测DN相关靶点,并和活性成分对应靶点取交集得到冬虫夏草治疗DN的潜在作用靶点,通过富集分析探索其作用机制.在String数据库中分析潜在作用靶点的蛋白相互作用(PPI),并借助Cytoscape构建可视化网络,进行网络拓扑分析筛选核心靶点.最后,对核心靶点与其对应成分进行分子对接验证.结果:筛选得到冬虫夏草活性成分17个,对应237个靶点,将其与232个DN相关靶点取交集得到32个潜在作用靶点.其中核心靶点为丝裂原激活蛋白激酶1(MAPK1)、丝裂原激活蛋白激酶8(MAPK8)和胱天蛋白酶3(CASP3),分子对接结果显示其与对应成分之间的结合活性较好.基因本体论(GO)富集得到39条生物过程(P<0.01),主要涉及凋亡过程的负调控、细胞对胰岛素刺激的反应等.京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集得到49条通路(P<0.01),主要包括催乳素信号通路、叉头框转录因子O亚型(FoxO)信号通路、缺氧诱导因子1(HIF-1)信号通路、磷脂酰肌醇3-激酶-蛋白激酶B(PI3K-Akt)信号通路、胰岛素抵抗、血管内皮生长因子(VEGF)信号通路等.结论:冬