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目的 基于网络药理学和分子对接技术探讨藤枝愈痹颗粒治疗类风湿关节炎的作用机制.方法 通过TCMSP数据库,以口服生物利用度(OB)≥30%和类药性(DL)≥0.18为条件筛选藤枝愈痹颗粒中鸡血藤、青风藤、海风藤、络石藤、桂枝、桑枝、豨莶草、薏苡仁的活性成分及成分靶点,并借助Uniprot数据库对成分靶点进行标准化处理.通过GeneCards数据库及DisGeNET数据库获取类风湿关节炎的潜在靶点,借助Venny 2.0.2数据库获取藤枝愈痹颗粒与类风湿关节炎的共有靶点,使用Cytoscape3.7.0软件构建中药-活性成分-共有靶点网络,并筛选度值靠前的成分作为核心成分.通过String数据库构建蛋白互作网络(PPI),并根据度值筛选排名靠前的靶点作为核心靶点.通过DAVID平台对共有靶点进行GO功能富集分析及KEGG通路富集分析,采用Autodock Vina软件对核心成分和核心靶点进行分子对接验证.结果 筛选得到藤枝愈痹颗粒与类风湿关节炎共有靶点85个,中药-活性成分-共有靶点网络分析得到木犀草素、山柰酚、甘草查耳酮A等10个核心成分,PPI分析得到白细胞介素6(IL-6)、信号转导及转录激活因子3(STAT3)、促分裂原活化的蛋白激酶8(MAPK8)等10个核心靶点,KEGG通路富集分析得到肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素17(IL-17)及磷脂酰肌醇3激酶-丝氨酸/苏氨酸蛋

作者:庄丽;陈照宇;韩光明;杨倩;张艳

来源:中国药业 2022 年 31卷 19期

知识库介绍

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作者:
庄丽;陈照宇;韩光明;杨倩;张艳
来源:
中国药业 2022 年 31卷 19期
标签:
藤枝愈痹颗粒 类风湿关节炎 网络药理学 分子对接 作用机制
目的 基于网络药理学和分子对接技术探讨藤枝愈痹颗粒治疗类风湿关节炎的作用机制.方法 通过TCMSP数据库,以口服生物利用度(OB)≥30%和类药性(DL)≥0.18为条件筛选藤枝愈痹颗粒中鸡血藤、青风藤、海风藤、络石藤、桂枝、桑枝、豨莶草、薏苡仁的活性成分及成分靶点,并借助Uniprot数据库对成分靶点进行标准化处理.通过GeneCards数据库及DisGeNET数据库获取类风湿关节炎的潜在靶点,借助Venny 2.0.2数据库获取藤枝愈痹颗粒与类风湿关节炎的共有靶点,使用Cytoscape3.7.0软件构建中药-活性成分-共有靶点网络,并筛选度值靠前的成分作为核心成分.通过String数据库构建蛋白互作网络(PPI),并根据度值筛选排名靠前的靶点作为核心靶点.通过DAVID平台对共有靶点进行GO功能富集分析及KEGG通路富集分析,采用Autodock Vina软件对核心成分和核心靶点进行分子对接验证.结果 筛选得到藤枝愈痹颗粒与类风湿关节炎共有靶点85个,中药-活性成分-共有靶点网络分析得到木犀草素、山柰酚、甘草查耳酮A等10个核心成分,PPI分析得到白细胞介素6(IL-6)、信号转导及转录激活因子3(STAT3)、促分裂原活化的蛋白激酶8(MAPK8)等10个核心靶点,KEGG通路富集分析得到肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素17(IL-17)及磷脂酰肌醇3激酶-丝氨酸/苏氨酸蛋