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目的:探索顺铂致肾间质纤维化的分子机制,为肾间质纤维化防治提供新思路。方法:使用8周龄C57BL/6雄性无特定病原体级小鼠建模,将小鼠分为顺铂组和生理盐水组,每组6只,分别于第0、7、21天腹腔注射顺铂溶液(10 mg/kg)或生理盐水,第28天时处死小鼠,取肾组织行RNA Illumina高通量测序、实时定量PCR、Western印迹、Masson染色及生物信息学分析。结果:通过实时定量PCR、Western印迹及Masson染色等验证,顺铂诱导的小鼠肾间质纤维化模型成功建立。RNA Illumina高通量测序结果显示,与生理盐水组相比,顺铂组差异表达长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)有387个,通过实时定量PCR验证排名前两位差异表达lncRNA的表达,趋势均与测序结果一致;差异表达mRNA 2 427个,其中补体C3在差异表达mRNA中排位第一。对测序结果行生物信息学分析,通过基因本体(GO)富集分析发现,与免疫相关的多个条目排位前20内;通过京都基因和基因组数据库(KEGG)富集分析发现,系统性红斑狼疮通路排位第一(ko05322, Q=3.4E-17),其中包含了补体级联反应通路。通过实时定量PCR验证发现,与生理盐水组比较,顺铂组补体C1q、C2、C3和C4 mRNA表达均升高(均 P<0.05),与测序结果一致。 结论:小鼠周

作者:冯敏;曾红惠;廖伟棠;苏佳楠

来源:中华肾脏病杂志 2021 年 37卷 10期

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作者:
冯敏;曾红惠;廖伟棠;苏佳楠
来源:
中华肾脏病杂志 2021 年 37卷 10期
标签:
顺铂 补体系统蛋白质类 计算生物学 肾间质纤维化 RNA高通量测序 Cisplatin Complement system proteins Computational biology Renal interstitial fibrosis RNA high-throughput sequencing
目的:探索顺铂致肾间质纤维化的分子机制,为肾间质纤维化防治提供新思路。方法:使用8周龄C57BL/6雄性无特定病原体级小鼠建模,将小鼠分为顺铂组和生理盐水组,每组6只,分别于第0、7、21天腹腔注射顺铂溶液(10 mg/kg)或生理盐水,第28天时处死小鼠,取肾组织行RNA Illumina高通量测序、实时定量PCR、Western印迹、Masson染色及生物信息学分析。结果:通过实时定量PCR、Western印迹及Masson染色等验证,顺铂诱导的小鼠肾间质纤维化模型成功建立。RNA Illumina高通量测序结果显示,与生理盐水组相比,顺铂组差异表达长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)有387个,通过实时定量PCR验证排名前两位差异表达lncRNA的表达,趋势均与测序结果一致;差异表达mRNA 2 427个,其中补体C3在差异表达mRNA中排位第一。对测序结果行生物信息学分析,通过基因本体(GO)富集分析发现,与免疫相关的多个条目排位前20内;通过京都基因和基因组数据库(KEGG)富集分析发现,系统性红斑狼疮通路排位第一(ko05322, Q=3.4E-17),其中包含了补体级联反应通路。通过实时定量PCR验证发现,与生理盐水组比较,顺铂组补体C1q、C2、C3和C4 mRNA表达均升高(均 P<0.05),与测序结果一致。 结论:小鼠周