目的 结合代谢组和计算生物学技术,探索食管癌代谢表型与病理分型的关系,发现食管癌患者代谢网络扰动机制,建立可用于术前快速对肿瘤进行精准分期的方法.方法 前瞻性队列研究设计,研究起止时间为2013年4月至2016年1月.纳入2013年5月至2014年4月在四川省人民manbet官网登录
确诊食管癌拟行手术患者,收集血清标本进行磁共振波谱代谢组学检测,绘制不同分期患者的血浆代谢指纹图谱.采用主成分分析、偏最小二乘法和支持向量机进行数据处理,并基于基因本体论(G0)方法建立代谢型-酶学网络-GO通路回溯分析技术探索调控食管癌代谢网络异常的酶-基因网络调节机制,最终建立食管癌分期定量预测模型.所有数据处理过程均在高性能计算平台上使用Matlab完成.计量资料的组间比较采用Wilcoxon秩和检验(非正态分布)或方差分析(正态分布).计数资料采用x2检验或Fisher确切概率法.结果 纳入不同TNM分期食管癌患者20例,不同分期患者组间年龄无差异(F=1.086,P>0.05),体重指数无差异(F=1.035,P>0.05),肿瘤距门齿距离无差异(F=1.078,P>0.05),其血浆磁共振波谱指纹图谱可特征性区分不同肿瘤分期.在不同TNM分期的患者中,其血浆代谢池中存在明显的代谢物差异:与ⅡB、ⅢA、Ⅳ期患者相比,ⅠB、ⅡA期患者血清中丁酮、乙醇胺、同型半胱氨酸、羟基丙
作者:陈星;王凯;陈伟;江华;邓鹏翅;李子建;彭谨;周志远;杨浩
来源:中华外科杂志 2016 年 54卷 7期