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目的:探讨微小RNA( miRNA)相关单核苷酸多态性( SNP )与结直肠癌发生发展之间的关系。方法收集30例结直肠癌患者的癌和癌旁组织,提取基因组DNA。将癌和癌旁组织混合,应用NimbleGen私人订制的芯片对685个miRNA基因目的区域进行捕获,经过洗脱扩增处理后,采用二代测序技术对捕获区域进行深度测序,并对测序数据进行分析。结果共鉴定43个miRNA的64个SNPs,其中60个SNPs为新发现。 TargetScan和mirSNP 检测结果显示, hsa?mir?1273?G/A、hsa?mir?548h?3?C/U、hsa?mir?1290?A/G和hsa?mir?1273?C/U突变后,其成熟miRNA的表达量降低。 hsa?mir?1268?U/C、hsa?mir?1268?C/U和hsa?mir?1285?1?U/C突变后其表达量增加。 hsa?mir?376b?C/G、hsa?mir?604?T/C、hsa?mir?1268?T/G 和 hsa?mir?146a?C/G 突变前后的靶基因均发生改变。 mir?146a rs1052918 C>G突变促进肿瘤的发展。结论 miRNA突变影响肿瘤的发生发展,在无Wnt信号的情况下,hsa?mir?146a突变后导致Wnt信号通路一直处于激活状态,导致细胞无限增殖。

作者:邱庆崇;刘杰;邵娇芳;楼小燕;陈辰;林标扬

来源:中华肿瘤杂志 2015 年 10期

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作者:
邱庆崇;刘杰;邵娇芳;楼小燕;陈辰;林标扬
来源:
中华肿瘤杂志 2015 年 10期
标签:
结直肠肿瘤 微RNAs 多态性,单核苷酸 Colorectal neoplasms MicroRNAs Polymorphism,single nucleotide
目的:探讨微小RNA( miRNA)相关单核苷酸多态性( SNP )与结直肠癌发生发展之间的关系。方法收集30例结直肠癌患者的癌和癌旁组织,提取基因组DNA。将癌和癌旁组织混合,应用NimbleGen私人订制的芯片对685个miRNA基因目的区域进行捕获,经过洗脱扩增处理后,采用二代测序技术对捕获区域进行深度测序,并对测序数据进行分析。结果共鉴定43个miRNA的64个SNPs,其中60个SNPs为新发现。 TargetScan和mirSNP 检测结果显示, hsa?mir?1273?G/A、hsa?mir?548h?3?C/U、hsa?mir?1290?A/G和hsa?mir?1273?C/U突变后,其成熟miRNA的表达量降低。 hsa?mir?1268?U/C、hsa?mir?1268?C/U和hsa?mir?1285?1?U/C突变后其表达量增加。 hsa?mir?376b?C/G、hsa?mir?604?T/C、hsa?mir?1268?T/G 和 hsa?mir?146a?C/G 突变前后的靶基因均发生改变。 mir?146a rs1052918 C>G突变促进肿瘤的发展。结论 miRNA突变影响肿瘤的发生发展,在无Wnt信号的情况下,hsa?mir?146a突变后导致Wnt信号通路一直处于激活状态,导致细胞无限增殖。