目的 比较甲状腺微小乳头状癌患者与甲状腺良性结节患者血浆小分子RNA(miRNA)表达谱的差异,初步分析差异miRNA靶基因的功能.方法 收集并分离5例甲状腺微小乳头状癌和5例甲状腺良性结节患者的血浆,采用miRNA-seq方法筛选出两组差异表达miRNA,进一步采用mirdbV5和TaregetScan7.1对差异表达miRNA进行靶基因预测,并运用Gene Ontology (GO)分析和KEGG信号通路数据库初步分析靶基因功能.结果 与甲状腺良性结节相比,甲状腺微小乳头状癌共有11个miRAN表达有显著差异,其中上调3个,下调8个;3个上调的miRNA通过两个软件共同预测到靶基因76个,8个下调miRNA共同预测到靶基因298个.上调miRNA靶基因GO分析提示与蛋白质修饰和细胞分解代谢有关.下调的miRNA靶基因GO分析结果提示与代谢以及生物合成有关.KEGG分析提示差异miRNA与RNA降解以及HIF-1信号通路相关. 结论 甲状腺微小乳头状癌与甲状腺良性结节miRNA表达谱存在明显差异,这些差异表达的miRNA可能与蛋白质修饰、细胞代谢以及生物合成、HIF-1信号通路有关.
作者:章晓芳;丁金旺;詹宇红;马丽珍
来源:浙江医学 2019 年 41卷 16期