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目的预测宫颈癌细胞中人类与鼠同源乳腺转化基因(HMATI)的功能及筛选出能有效沉默该基因的干扰小RNA.方法采用细胞原癌基因、抑癌基因分类芯片对原发性宫颈癌标本进行筛选,通过生物信息学分析HMAT1基因,针对HMAT1基因设计了三条特异性干扰小RNA,分别与pRNAU 6.1-Hygro重组后,与含有该基因的重组体瞬时共转染B16F0细胞,用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)技术检测对HMAT1基因的干扰效果.结果细胞原癌基因、抑癌基因分类芯片筛选出表达量明显上调的基因共四条.对其中上调明显的HMAT1基因,通过生物信息学预测其为一个调节细胞生长的看家基因,其编码的蛋白质为一个Ⅰ型跨膜蛋白,且其酪氨酸蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点可能与HMAT1蛋白功能活化有关.半定量检测结果表明其中第一条特异性干扰小RNA有显著性抑制效果(P<0.05).结论初步预测HMAT1基因很可能是与宫颈癌相关的癌基因,其编码的蛋白质可能参与细胞的信号转导,设计出针对该基因的干扰小RNA可以有效沉默HMAT1基因.

作者:欧璇;赵旻;左泽华;李辉;魏芸;伍欣星

来源:肿瘤 2005 年 25卷 2期

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作者:
欧璇;赵旻;左泽华;李辉;魏芸;伍欣星
来源:
肿瘤 2005 年 25卷 2期
标签:
宫颈肿瘤 寡核苷类排列序列分析 HMATI基因 RNA干扰
目的预测宫颈癌细胞中人类与鼠同源乳腺转化基因(HMATI)的功能及筛选出能有效沉默该基因的干扰小RNA.方法采用细胞原癌基因、抑癌基因分类芯片对原发性宫颈癌标本进行筛选,通过生物信息学分析HMAT1基因,针对HMAT1基因设计了三条特异性干扰小RNA,分别与pRNAU 6.1-Hygro重组后,与含有该基因的重组体瞬时共转染B16F0细胞,用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)技术检测对HMAT1基因的干扰效果.结果细胞原癌基因、抑癌基因分类芯片筛选出表达量明显上调的基因共四条.对其中上调明显的HMAT1基因,通过生物信息学预测其为一个调节细胞生长的看家基因,其编码的蛋白质为一个Ⅰ型跨膜蛋白,且其酪氨酸蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点可能与HMAT1蛋白功能活化有关.半定量检测结果表明其中第一条特异性干扰小RNA有显著性抑制效果(P<0.05).结论初步预测HMAT1基因很可能是与宫颈癌相关的癌基因,其编码的蛋白质可能参与细胞的信号转导,设计出针对该基因的干扰小RNA可以有效沉默HMAT1基因.