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目前,利用芯片技术和miRNA测序可快速、准确地检测到物种中所含有的miRNA.随着越来越多的miRNA被发现,miRNA靶基因的确定已成为研究miRNA生物学功能的关键.传统的miRNA靶基因的寻找主要依赖生物信息学预测、AGO蛋白免疫共沉淀和荧光素酶法等.随着高通量测序技术的持续革新,出现了一种新的miRNA靶基因的检测方法,即降解组测序(degradome sequencing)法,该方法拥有高通量测序技术、生物信息学分析和RACE验证三者的优势,并已成功应用于拟南芥(Arabidopsis thaliana)、水稻(Oryza sativa)和小立碗藓(Physcomitrella patens)等模式植物miRNA靶基因的检测.基于已发表的相关文献和联川生物降解组测序平台,该文对降解组测序技术应用于植物miRNA靶基因的研究进展及其实验原理进行了综述,同时对运用该技术可进行的更深入研究进行了讨论.
作者：董淼；黄越；陈文铎；徐涛；郎秋蕾
来源：植物学报 2013 年 48卷 3期
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