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目的:通过网络药理学及分子对接技术探寻玉屏风散治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的活性化合物.方法:借助中药系统药理学分析平台(TCMSP)检索玉屏风散中防风、黄芪、白术的化学成分和作用靶点.通过UniProt、GeneCards、OMIM等数据库查询靶点对应的基因,进而运用Cytoscape 3.7.2构建药材-化合物-靶点网络,通过STRING数据库构建靶蛋白相互作用(PPI)网络,通过DAVID进行基因本体(GO)功能富集分析和基于京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,预测其作用机制,将药材-化合物-靶点网络中排名前8的成分与新型冠状病毒(2019-nCoV)3CL水解酶及血管紧张素转化酶Ⅱ(ACE2)进行分子对接.结果:药材-化合物-靶点网络包含3个药材,44个化合物和相应靶点198个,关键靶点涉及PTGS2、DPP4、HTR、PTGS1、HSP90AA1等.蛋白相互作用(PPI)网络得到玉屏风散治疗新型冠状病毒肺炎的42个关键靶点蛋白.GO功能富集分析得到GO条目1 632个(P<0.05),其中生物过程(BP)条目1 539个,细胞组成(CC)条目17个,分子功能(MF)条目76个.KEGG通路富集筛选得到20条信号通路(P<0.05),相关的靶点对应25个成分,涉及糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、IL-17信号通路、南美锥虫病、肿瘤坏死因子信号通路及百日咳等通路.分子对接结果显示5-O-甲维阿斯米

作者:谢平;何少贵;郝春莉;游其华;沈金海;赖源发;赵晶

来源:中药材 2020 年 43卷 6期

知识库介绍

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作者:
谢平;何少贵;郝春莉;游其华;沈金海;赖源发;赵晶
来源:
中药材 2020 年 43卷 6期
标签:
玉屏风散 新型冠状病毒肺炎 网络药理学 分子对接
目的:通过网络药理学及分子对接技术探寻玉屏风散治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的活性化合物.方法:借助中药系统药理学分析平台(TCMSP)检索玉屏风散中防风、黄芪、白术的化学成分和作用靶点.通过UniProt、GeneCards、OMIM等数据库查询靶点对应的基因,进而运用Cytoscape 3.7.2构建药材-化合物-靶点网络,通过STRING数据库构建靶蛋白相互作用(PPI)网络,通过DAVID进行基因本体(GO)功能富集分析和基于京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,预测其作用机制,将药材-化合物-靶点网络中排名前8的成分与新型冠状病毒(2019-nCoV)3CL水解酶及血管紧张素转化酶Ⅱ(ACE2)进行分子对接.结果:药材-化合物-靶点网络包含3个药材,44个化合物和相应靶点198个,关键靶点涉及PTGS2、DPP4、HTR、PTGS1、HSP90AA1等.蛋白相互作用(PPI)网络得到玉屏风散治疗新型冠状病毒肺炎的42个关键靶点蛋白.GO功能富集分析得到GO条目1 632个(P<0.05),其中生物过程(BP)条目1 539个,细胞组成(CC)条目17个,分子功能(MF)条目76个.KEGG通路富集筛选得到20条信号通路(P<0.05),相关的靶点对应25个成分,涉及糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、IL-17信号通路、南美锥虫病、肿瘤坏死因子信号通路及百日咳等通路.分子对接结果显示5-O-甲维阿斯米